深圳國際交流學(xué)院——重磅連擊！校友邵巖以第一作者在同期《自然》期刊發(fā)表科研論文！

上周，當(dāng)我們因為2012屆校友孟根屹發(fā)現(xiàn)了一種革命性的高通量點擊化學(xué)化合物庫的建立方法，并在《Nature》期刊上發(fā)表了影響力重大的科研論文而興奮不已時，幾乎同時，我們又獲悉2011屆校友、劍橋博士邵巖在同期《Nature》期刊上也以第一作者的身份發(fā)表了他的科研論文。

深圳國際交流學(xué)院2011屆校友 邵巖

上周，當(dāng)我們因為2012屆校友孟根屹發(fā)現(xiàn)了一種革命性的高通量點擊化學(xué)化合物庫的建立方法，并在《Nature》期刊上發(fā)表了影響力重大的科研論文而興奮不已時，幾乎同時，我們又獲悉2011屆校友、劍橋博士邵巖在同期《Nature》期刊上也以第一作者的身份發(fā)表了他的科研論文。

這篇文章闡述道，邵巖所在的研究組通過高通量全基因組測序和分析，進行了迄今為止對新生兒腸道菌群規(guī)模最大，精度最高的研究。他們提供了強有力的證據(jù)表明，不同分娩方式對生命早期腸道菌群發(fā)育起著決定性作用。研究組希望通過腸道微生物研究，能夠幫助貧困國家預(yù)防和改善兒童的營養(yǎng)不良問題，也有助于結(jié)束富裕國家兒童肥胖癥的流行，防止哮喘、過敏和一些自身免疫性疾病。

這篇文章于英國時間9月18日于Nature官網(wǎng)上線，當(dāng)天就被英國以及國際各大主流媒體首頁報道。近一個月來文章下載量超過3.7萬次，論文影響力(Altmetric)指數(shù)在同期Nature 文章(4/484)和所有科研文章(23/174,693)中均列1%。同時，國內(nèi)包括新華社在內(nèi)各大中文網(wǎng)站和科普自媒體也對這一研究進行介紹(鏈接見文末)。10月3日，文章被正式刊登在 Nature 雜志第574卷，第7776期。

現(xiàn)在，我們不妨一起來看看這位年輕科學(xué)家的求學(xué)與科研之路~

Q：

能不能講述一下你高中之后的求學(xué)經(jīng)歷?

2011年我進入倫敦帝國理工生命科學(xué)系，進行本科學(xué)習(xí)。母校濃厚的學(xué)術(shù)氛圍和緊貼科研的教學(xué)課程，有助于我在本科期間培養(yǎng)較強的科研素養(yǎng)，這體現(xiàn)在大量的前沿文獻批判性閱讀，論文、綜述和研究計劃的撰寫，以及在實驗室的科研實習(xí)經(jīng)歷。

大一大二暑假期間，我得到英國Gatsby 慈善基金會的全額資助，先后被篩選參加暑期科研培訓(xùn)項目。我有幸進入世界最頂尖的微生物和植物研究所英國John Innes Centre 和The Sainsbury Laboratory進行科研實習(xí)，和“教科書里的”科學(xué)家們工作交流。

2014年本科畢業(yè)后，我回到深圳進入華大基因?qū)嵙?xí)。在積累工業(yè)界工作經(jīng)驗的同時，進一步學(xué)習(xí)生物信息和大數(shù)據(jù)分析技術(shù)。這些寶貴經(jīng)歷讓我深刻體會到最頂尖的科研成果是怎樣“煉”成的，也讓我找到了最感興趣的科研方向—微生物-宿主相互作用和基因組學(xué)。

2015年，我得到Wellcome Trust (世界最大的慈善基金之一) 的全額獎學(xué)金，開始在劍橋大學(xué)為期四年的博士學(xué)習(xí)，并進入基因組學(xué)研究“圣地” Sanger 研究所展開人類腸道微生物組學(xué)研究。具體來說，我的研究課題是利用大規(guī)?；蚪M測序和高通量細菌分離培養(yǎng)技術(shù)，研究生命早期人體腸道微生物群從無到有的發(fā)展過程，以及其與生命后期哮喘等過敏性疾病的關(guān)系。

Q：

這次在Nature上面發(fā)表的文章，能具體講講是什么樣的研究和發(fā)現(xiàn)嗎?

其實我們的體內(nèi)只有約一半細胞是人體細胞，另一半則代表著由數(shù)億個微生物和病毒組成的，遍布各個器官的微生態(tài)系統(tǒng)。這其中以人體腸道內(nèi)的微生物菌群最為龐大和最復(fù)雜，也和我們的代謝，免疫系統(tǒng)最緊密相連。許多研究表明，受到飲食，服用抗生素，壓力等影響時人體腸道微生物群會出現(xiàn)失調(diào)，并可能會誘發(fā)癌癥和肥胖、炎癥性腸病等疾病。然而在嬰兒出生的最初幾周內(nèi)，腸道微生態(tài)系統(tǒng)是怎樣完成從一無所有到龐大復(fù)雜的發(fā)育過程呢?有哪些因素會影響嬰兒腸道菌群的發(fā)育?嬰兒腸道菌群的發(fā)育缺陷是否會造成后期自身免疫性疾病(如哮喘，過敏)?

帶著這些問題，我們研究組和合作者們展開了一項為時七年的大型出生隊列研究 (2012年起籌辦, 2015年起大規(guī)模招募、采樣)，并將其中一項重大發(fā)現(xiàn)在Nature 上發(fā)表。在這篇文章中，我們通過高通量全基因組測序和分析，進行了迄今為止對新生兒腸道菌群規(guī)模最大，精度最高的研究。我們提供了強有力的證據(jù)表明，不同分娩方式對生命早期腸道菌群發(fā)育起著決定性作用。

我們發(fā)現(xiàn)，在順產(chǎn)情況下，嬰兒通過母親產(chǎn)道時出生時“繼承”了許多母親糞便中的腸道細菌。這類母嬰間傳播的細菌不但對對腸道健康有益，也是生命早期腸道菌群發(fā)育過程中的“主心骨”;而在剖腹產(chǎn)過程中，我們發(fā)現(xiàn)這種來自母親的腸道菌群”遺傳”幾乎被徹底破壞。令人驚訝的是，剖腹產(chǎn)出生的嬰兒不但永久無法得到來自母體的有益腸道菌，反而攜帶著非常高比例的，在醫(yī)院環(huán)境中常見的潛在致病細菌。至于剖腹產(chǎn)嬰兒在出生后的腸道菌群紊亂以及攜帶大量致病菌對他們的健康究竟有著怎樣的影響，請關(guān)注我們接下來的臨床研究。

Q：

你今后的研究方向會是什么?

在順利完成博士學(xué)業(yè)后(最近順利通過畢業(yè)答辯)，我在未來一兩年內(nèi)會留在當(dāng)前的研究團隊完成其他將要發(fā)表的工作。同時，我們也將目光放眼全球，在蓋茨基金會(Bill & Melinda Gates Foundation)的資助下，和中低收入國家的研究人員合作，展開對非洲和拉丁美洲嬰兒腸道菌群的大型隊列研究。

近期，我將拜訪位于肯尼亞，南非和烏拉圭的合作者進行學(xué)術(shù)交流和知識傳遞。我們希望通過腸道微生物研究，能夠幫助貧困國家預(yù)防和改善兒童的營養(yǎng)不良問題，也有助于結(jié)束富裕國家兒童肥胖癥的流行，防止哮喘、過敏和一些自身免疫性疾病。

深國交校友邵巖和孟根屹在10月3日Nature期刊上同期發(fā)表的科研論文

我們真誠地祝賀在科研領(lǐng)域有著如此重大發(fā)現(xiàn)、取得突出成就的校友們，是你們的潛心鉆研和鍥而不舍為世界科技發(fā)展助力，為人類生活帶來福祉。

你們，是改變世界的人!深國交作為母校因你們而驕傲!

相關(guān)媒體對于該論文的報道

(可復(fù)制鏈接到網(wǎng)頁閱讀)

Nature 原文(pdf):

https://rdcu.be/bUiaS

Sanger 研究所媒體通稿:

https://www.sanger.ac.uk/news/view/babies-gut-bacteria-affected-delivery-method-baby-biome-project-shows

Nature 同期配發(fā)的新聞專題:

https://www.nature.com/articles/d41586-019-02807-x

Nature 中文微信推送:

https://mp.weixin.qq.com/s/JKvnQbkVEFBKUjgBspeEWg

國際各大主流媒體報道:

路透社:

https://uk.reuters.com/article/us-health-babybiome/baby-gut-study-finds-bacteria-different-after-c-section-births-idUKKBN1W32CB

法新社:

https://www.france24.com/en/20190918-gut-feeling-how-c-sections-change-a-baby-s-gut-ecosystem

新華社:

http://www.xinhuanet.com/world/2019-09/20/c_1125018899.htm

英國BBC:

https://www.bbc.co.uk/news/health-49740735

英國 Sky News:

https://news.sky.com/story/babies-born-by-c-section-lack-healthy-gut-bacteria-from-mother-study-finds-11813777

英國每日電訊報(頭版):

https://www.telegraph.co.uk/science/2019/09/18/gut-bacteria-caesarean-babies-found-abnormal-bringing-fears/

英國衛(wèi)報:

https://www.theguardian.com/society/2019/sep/18/caesarean-babies-have-different-gut-bacteria-microbiome-study-finds

美國CNN：

https://edition.cnn.com/2019/09/18/health/babies-gut-microbiome-birth-vaginal-c-section-intl/index.html

西班牙 El País:

https://elpais.com/elpais/2019/09/18/ciencia/1568820835_254811.html

中文科普媒體解讀：

生物探索：Nature迄今最大規(guī)模研究證實：剖腹產(chǎn)寶寶缺少關(guān)鍵菌群

https://www.biodiscover.com/news/park/735470.html

學(xué)術(shù)經(jīng)緯：剖腹產(chǎn)果然會影響嬰兒菌群!《自然》發(fā)布迄今最大規(guī)模研究

https://mp.weixin.qq.com/s/Pu-0jDCUiFXHysxDccTSXQ

奇點網(wǎng)：《自然》：剖宮產(chǎn)毀腸菌!迄今最大規(guī)模研究表明，分娩方式會嚴(yán)重影響嬰兒腸菌，剖宮產(chǎn)嬰兒微生物多來自醫(yī)院，是潛在致病菌丨臨床大發(fā)現(xiàn)

https://mp.weixin.qq.com/s/xI1JP8J7Fe_tdkRVqoq90A

知幾未來研究院：打臉“陰道播種”| Nature刊發(fā)迄今最大規(guī)模新生兒菌群研究，發(fā)現(xiàn)順產(chǎn)兒腸道菌來自母親腸道而非陰道，剖宮產(chǎn)兒則多是醫(yī)院致病菌

https://mp.weixin.qq.com/s/xTIvrcixMGBHGC5mKbqlWQ

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